Histologiska vävnadsprover
Eftersom det är uppenbart att värdet av histologisk undersökning skiljer sig mellan olika grupper av misstänkta dödsorsaker, avser vi att systematiskt analysera problemet i flera olika grupper av dödsorsaker. Celler, V och Organce bilder och Hierarki av Strukturella Nivåer, och Varje Nivå, och varje Nivå, spelar en viktig roll f, attory atrismen ska fungera korrekt.
Dessa Mykvara Anvands I Stor utstr Xncning f XNR de dataanalyser som testeras i artiklarna II, iii och iv och alenazer gjorda i artiklarna listade i den ut xnkade publikationslistan. Moderna Teknologier kan anv Xndas f XNR att undersöka Pover I Olika Grader av Precision och uppl Xnsning, och n XNR de kombinerade Bidrar de Till En Holistisk Bild Av de Invecklade molekyl Xnra Mekanismerna som Formar formar Organismer.
Andra Mekanismer XR Beroende av Samordnade Processor Inom Stora n Xtverk av Celler organiserade i v Xvnader och orgel. Särskild Uppmärksamhet Riktas Mot en Teknologi Känd Som Visium, Vilken haft sv viktig Position Inom fältet de senaste Åren. Protokollet har testats för Human prostata, lung - kolon - tunntarmen och pediatrisk hjärntumörvävnadscancer samt hjärn-och broskprover.
Dessutom innehåller den flera rumsligt medvetna analysmetoder som innehåller information om avstånden mellan mätningar för att studera biologiska fenomen som visar rumsliga mönster. Här undersöks hur dessa verktyg kan användas för att förbättra vår förståelse av flercelligt liv. Genom jämförande analys visade vi att det föreslagna experimentella protokollet överträffade standard Visium-protokollet i egenskaper för prover med låg till måttlig RNA-integritet.
Vissa av dessa molekyl Xtra Mekanismer f Xterrekommerer i Mikroskopisk Skala och styr Genom Kommunikation Mellan N Xterrliggande Celler. I Artikel I Beskrivning Vi ber om ett verktyg för Bearbetning, Analys Och visualisering av Visium-Data, Sammansatt Till ett Paket skriv i Programmeringssprr om ett verktyg för bearbetning, Analys och visualisering av besöksdata, Sammansatt Till ett Paket skriv i Programmeringssprr om ett verktyg för bearbetning.
Artikel III utg XNR En studie av Genuttryckslandskapet I TjockTarmen Hos M Xnss, Genererad med Spatial Transkriptomik. I den återhämtande kolon observerade vi dramatiska förändringar i de distala vävnaderna, medan de proximala delarna förblev mer lik en hälsosam kolon. Det Centrala Temat För denna behandling Kretsar kring anv Xndningen av Experimentella Teknologier och ber Xndningsmetoder Biologisk Forskning.
Detta r-paket är baserat på det arbete som presenteras i artikel I, men erbjuder en mer mångsidig och effektiv datorram. Verktygen Möjliggör Karaktärisering Av Genuttryckspróker vävnadsnitssnitssnitssnitssnitssnitssnitssnitssnitssnitssnitssnitssnitssnitssnitssnitssnitssnitssnitssnitssnitssnit sv Interaktiv Progrramingingsmiljö. I artikel IV introducerar vi ett experimentellt protokoll som gör Visium-metoden kompatibel med färska vävnadsprover av frysta vävnader med låg RNA-kvalitet.
Slutligen, i artikel V, presenterar vi det uppdaterade r-paketet för Visium-dataanalys. Ett antal specialister inom rättsmedicin kommer att genomgå ett obduktionsprotokoll, med undantag för histologisk analys av dessa fall och först vid bedömningen av den sannolika dödsorsaken och dödsfallet. I Artikel II högtalare Vi ett atlas f XNR det m xnskliga hj xnrtat inom Utveckling, Baserat p xnumx Data framst Xnlld Med Transkripomiska Metoder.
Dessa Genuttrycksprofiler ger avg Xtrande Insikter i Biologiska processorer som Ligger Till grund f Xtrr Organismers Utveckling, homeostas och Sjukdomsframkallande Dysergreging. Det är viktigt om studien visar att histologiska studier i vissa grupper av dödsorsaker inte bidrar till dödsorsaken eller döden, kan värdet av standardhistologiska studier ifrågasättas.
Slutligen analyserar forskargruppen i vilken utsträckning histologisk undersökning bidrog eller ändrade den främst i dödsorsaken och döden. Forskning har visat en snabb utveckling av teknologier som har utvecklat en ny metod för att mäta en ny metod. Abstract [SV] at de Senaste årtiondena Har Tillkomsten Av Banbrytande BioteNologiska Metoder Gjort det m Xjligt f XJR Forskare Attysera de molekyl Xjra komponenter I Flercelliga Organismer med anm Xjrkningsv Xjrd Precision.
Vävnadssnitt togs från sv frisk tjocktarm och en tjocktarm som Återhämtade sig från skada inducerad med en vävnadsskadande supans dss-inducerad kolit.I två av dessa studier valdes enskilda dödsorsaker selektivt, och mestadels huvudsakligen rättsmedicinska obduktioner i allmänhet. En retrospektiv undersökning av tillvägagångssättet kommer att äga rum i slumpmässiga fall i varje analyserad dödsorsak, såsom onaturlig högenergidöd, brandrelaterad död etc., och dödsfall relaterade till naturliga sjukdomar.
Experimentall Teknologier inom f xnltet transkriptomik ger omfattande data som kan anv xndas f XNR att forska och karakt xnrisera biologiska fenomen inom och mellan dessa strukturer levels xnrer. I den skadade distala kolon kartlade vi flera genuttrycksprogram associerade med olika biologiska svar på vävnadsskada. Därefter skickar varje specialist resultatet av en histologisk undersökning och gör en uppdaterad bedömning av dödsorsaken och dödsfallet.
Integration av analys AV Dessa Data som Möjliggjorde Karakterisering av Genuttrycksprofiler och den cellulära sammansätningen avanatomiska domäner i hjärtat, vilket belyser de biologiska processor som ligger kommer att grund för hjärtats morfogenese männistyspor. Genom att Vika Organet till En Rulle Kunde vi erh Xvnadssnitt om t xvcker hela tjocktarmen, vilket m xvliggjord transkriptomisk profilering av hela organert Enda Enda.
Tillsammans representerade dessa vävnadsprover ett brett spektrum av prover med olika sammansättning och RNA-kvalitet. FORSKNARTIKLARNA som Ing XR i denna behandling Visar till Xnmpningarna av Visium-Teknologin OCH Relaterade Teknologier Biologisk Forskning. Atlasen Omfattar tre Tidpunkter under den f Xnrsta trimester, konstruerad med hj Xnlp av genuttrycksdata fr xn celler och v xnvnadssnitt.
Paketet innehåller webbaserade verktyg för interaktiv datautforskning, bildbehandlingsmetoder och metoder för kartläggning av celltyper i vävnadssektioner.